東京分行於2017年開業，位於東京車站旁金融區丸之內大樓，為本行第一個東北亞據點。日本政經穩定，金融市場成熟，為台灣第二大貿易夥伴。東京為日本最重要的政治金融中心，企業總部聚集，商業活動熱絡。東京分行將發揮區域金融中心的特性，提供顧客存匯服務、融資及匯率避險平台，結合玉山在台灣、中國及東協等海外據點，提供完整的亞洲金融服務網絡。
分行位在東京金融區丸之內大樓中，可由以下方式前往：
JR線：東京車站，步行約6分鐘。
地鐵站：大手町站、二重橋前站，步行約5分鐘。
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服務專線：+81-3-6213-1301
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傳真專線：+81-3-3201-5755
- SWIFT：ESUNJPJT
